Es miembro del Comité Ejecutivo de la Junta de Beneficencia de Guayaquil, así como del Centro Educativo Técnico–Laboral Montepiedra.

Pertenece al Directorio de la Casa del Hombre Doliente. Fue Presidente de la Cámara de Industrias de Guayaquil y Miembro del Directorio de la Corporación Financiera Nacional (C.F.N).

Ernesto Noboa ha sido Subsecretario del Ministerio de Agricultura (1984-1985) y se desempeñó como Gerente General de la Corporación Jabonería Nacional S.A. y Vicepresidente de la Sociedad Financiera Financapital.